“污秽”是自异世界“祸野”现身，危害人世的怪物。而“阴阳师”长年以来则与污秽战斗至今。
国中生少年·焰魔堂辘轤曾以成为能祓除所有污秽的最强阴阳师为目标，但自从遭遇了“雏月之悲剧”后，他便放弃成为阴阳师。
此时，在这样的辘轤面前，出现了一名少女·化野红绪，这名来自京都的少女，同样以祓除污秽为理想，并展现了惊人的实力……
本作品中，作为阴阳师候补生的少年·焰魔堂放弃过去想要成为阴阳师的梦想，每天过着日常的生活。而他跟阴阳师少女·化野红绪共同被称为“双星之阴阳师”。不过双星的任务是生下终结灾祸的“神子”，为此需要他们以夫妻身份生活。当然，两人对此拒绝接受，并齐心协力向命运挑战……
